La colección de embarcaciones incluye más de 250 pequeñas embarcaciones de interior y refleja el desarrollo y el perfeccionamiento de la fabricación de embarcaciones regionales, desde una canoa de los nativos americanos (1958.350.0001) hasta una canoa abierta de Kevlar de 1989 (2005.027.0001). La mayoría de las embarcaciones datan de entre 1880 y 1950. La lancha guía Adirondack, uno de los artefactos culturales más importantes de la región, está bien representada con más de 70 ejemplares. Hay 32 ejemplos fabricados por el constructor de barcos pequeños más conocido de la región en el siglo XIX, J.H. Rushton de Canton, Nueva York. La colección de embarcaciones también incluye patrones, motores, remos y palas, velas, silbatos de vapor, asientos y respaldos, luces, anclas, bombas de achique, herrajes, cubiertas para embarcaciones, lastres, defensas, herramientas y bancos de trabajo para constructores y otros accesorios relacionados con las embarcaciones.